ESS - DM -Técnicas Laboratoriais em Biopatologia
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Browsing ESS - DM -Técnicas Laboratoriais em Biopatologia by advisor "Cirnes, Luís"
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- Análise de variantes no gene STK11 e sua influência na resposta à imunoterapiaPublication . Bessa, Ana Filipa Moreira; Cirnes, Luís; Silva, Regina Augusta Alves Pereira daA imunoterapia é uma ferramenta terapêutica de sucesso usadas no tratamento do cancro de pulmão, contudo alguns doentes não respondem à imunoterapia, apresentando progressão da doença ou morte. Uma das possíveis explicações para o insucesso da imunoterapia são alterações no gene Serine/ threonine Kinase 11 (STK11), que podem conferir resistência à terapia, uma vez que este tem grande influência no sistema imunológico. O objetivo deste projeto é estudar alterações genéticas no STK11 em pacientes com cancro de pulmão sujeitos a imunoterapia e a sua possível associação com a resposta do doente à terapêutica. Foram selecionados 38 doentes, procedeu-se à extração do ácido desoxirribonucleico (DNA), seguindo-se a realização da reação em cadeia da polimerase (PCR) para amplificação do STK11, o qual foi sequenciado para pesquisa de alterações genéticas. Foram detetadas e classificadas como patogénicas ou provavelmente patogénicas 14 alterações no STK11, não tendo sido identificado um codão ou exão com mais propensão a alterações. Pacientes com alterações no STK11 apresentaram pior sobrevida global e pior sobrevida livre de progressão de doença. Estes resultados sugerem que o STK11 deve ser estudado na sua totalidade aquando da decisão terapêutica e que deve ser incluído em painéis de Sequenciação de Nova Geração (NGS).
- Implementação do estudo molecular do gene KEAP1 na rotina laboratorial dos casos de cancro do pulmãoPublication . Nascimento, David Jorge dos Santos; Cirnes, Luís; Silva, ReginaO cancro do pulmão é o tipo de neoplasia com maior taxa de mortalidade no mundo, tendo sido reportadas 1 796 144 mortes em 2020, representando 18% das mortes relacionadas com cancro. Esta grande taxa de mortalidade deve-se ao facto de o diagnóstico ser efetuado apenas num estadio já avançado, onde só estão disponíveis a imunoterapia, quimioterapia ou terapias dirigidas como opções de tratamento. Contudo, muitos cancros do pulmão são resistentes a estes tipos de terapia, devido a alterações genéticas e proteómicas que ocorrem no ambiente tumoral. Uma das alterações que pode contribuir para o aparecimento destas resistências são mutações no gene KEAP1. O estágio teve como objetivo implementar o estudo mutacional para a pesquisa de mutações no gene KEAP1 através de sequenciação de Sanger. Este estudo foi posteriormente validado utilizando 39 casos de doentes diagnosticados com Cancro do Pulmão de Não Pequenas Células submetidos a imunoterapia, nos quais não foram detetadas mutações acionáveis, tendo sido encontradas cinco mutações das quais três são consideradas provavelmente patogénicas. Apesar desta classificação, três das mutações estão associadas a casos com uma boa resposta à imunoterapia, sendo preciso mais estudos para elucidar o seu papel na decisão terapêutica.
- Reclassificação de variantes: painéis NGS alargados, de pacientes com tumores sólidos, elegíveis para tratamento com PARPIsPublication . Ferraz, Marta Isabel Jesus; Cirnes, Luís; Granja, Sara CostaO desenvolvimento das tecnologias de Sequenciação de Nova Geração (NGS) acelerou a identificação de alterações genéticas em patologias humanas, possibilitando diagnósticos mais precisos e terapias direcionadas. A maioria dos cancros resulta da acumulação de mutações somáticas, estando algumas delas ligadas diretamente a um tipo de tumor, no entanto, diferentes tipos de cancro podem também ter origem na mesma mutação. Assim sendo, a um determinado tipo de cancro que tem origem em diferentes mutações genéticas podem ser aplicadas terapias distintas, e no caso de diferentes tipos de cancro com a mesma mutação pode ser-lhes aplicada a mesma terapia. Este trabalho teve como objetivo identificar e classificar variantes genéticas nos genes BRCA, associadas à deficiência da recombinação homóloga, em 17 pacientes com diferentes neoplasias, visando a identificação de alvos terapêuticos para o tratamento com inibidores da Poli (ADP-ribose) Polimerase (PARPIs). Foi possível a identificação de uma variante patogénica no gene BRCA1 e uma variante provavelmente patogénica BRCA2 em apenas um paciente com neoplasia da próstata em estadio avançado. Este tipo de diagnóstico molecular leva cada vez mais ao aumento da medicina de precisão, um dos avanços mais importantes da biologia.
- Transcripts as modifiers of phenotypic variability in hereditary transthyretin-mediated amyloidosis biopsiesPublication . Gouveia, Ana Maria Furtado; Ferreira, Miguel Alves; Cirnes, Luís; Granja, SaraHerditary transthyretin-mediated amyloidosis (ATTRv) is a severe disease, dominat, autosomal amyloidois characterized by a progressive polyneuropathy, due to a point mutation in TTR gene, causing the deposition of amyloid fibrils in peripheric nerves. Due to wide variability in age-at-onset (AO), two main groups were stablished, early-onset (AO˂50 years) and late-onset (AO≥50 years). The main goal of this project was the analysis of RNA transcripts theta could act as modifiers of phenotypic variablility in ATTRv patient biopsies. Therefore, it was stablished wo main steps: (A) extraction and quantification of RNA from paraffin biopsies and (B) analysis of RNA transcripts that will allow to explain phenotypic variability in ATTRv. Five differentially expressed genes were identified in salivar gland samples. MGAM2 gene stood out between the other four genes due to its higher expression in the early AO group. This gene may be associated with the inhibition of a protectice factor that was not identified yet. Overall, our study may be a precursor to future exploration of proein-protein interactions, as well as the SNPs detection in differentially expressed genes that may modulate the phenotypic variability in ATTRv.