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Fatores pré-analíticos que influenciam a sequenciação de nova geração (NGS): experiência IPO Coimbra

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A Sequenciação de nova geração (Next-generation sequencing (NGS)) refere-se a uma tecnologia de sequenciação de alto rendimento. O uso da NGS especificamente aplicada à caracterização de tumores sólidos, enfrenta desafios significativos devido à natureza dos tecidos disponíveis para análise. O Tecido Fixado em Formol e Impregnado em Parafina (TFFIP) é o método mais utilizado para preservar a morfologia histológica, os ácidos nucleicos e as proteínas para fins de diagnóstico. O objetivo deste trabalho foi a avaliação da influência dos fatores préanalíticos a que os tecidos estão sujeitos no Laboratório de Histologia do Instituto Português de Oncologia de Coimbra (IPOC). Os resultados deste estudo mostraram que a duração de fixação, o tipo de processamento, a área tumoral e o período de arquivo dos blocos de parafina impactam na quantidade e qualidade de ADN recuperado de TFFIP. Desta experiência conclui-se que a duração de fixação dos tecidos não deve ultrapassar os quatro dias. O processamento que menos compromete a quantidade e qualidade de ADN foi aquele em que o agente diafanizador foi o xilol e deve ser utilizada parafina com ponto de fusão que não ultrapasse os 62°C. Efetivamente, os fatores pré-analíticos devem, sem qualquer dúvida, ser bem controlados de modo a garantir que estudos moleculares posteriores não sejam comprometidos.

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Sequenciação de nova geração (NGS) Ácido desoxirribonucleico (ADN) Tecido fixado em formol e impregnado em parafina (TFFIP) Fatores pré-analíticos

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