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- Relatório de estágio: Aplicações biomédicas em doenças metabólicas, infeciosas e regeneraçãoPublication . Dias, Maria Clara; Fernandes, Rúben; Baylina, PilarO presente documento reflete o trabalho de estágio realizado num laboratório multidisciplinar e multicêntrico, o Laboratório de biotecnologia Médica e Industrial (LaBMI). Este laboratório situa-se no Porto Research, Technology and Innovation Center (PORTIC) do Instituto Politécnico do Porto. O LaBMI acolhe ainda, uma start-up embrionária, a AP Factory, acompanhada e com o apoio de técnico e de gestão da STARTUP PORTO da PORTO GLOBAL HUB (PGH) mas com a mentoria científica da equipa de coordenação do LaBMI. Desta forma, parte do estágio foi realizado também na AP Factory, que utiliza parte dos laboratórios do LaBMI, sob a responsabilidade dos gestores desta start-up. Durante o estágio, foram realizadas diversas atividades de aprendizagem e em diferentes âmbitos, o que permitiu uma oportunidade ímpar de aprendizagem de métodos, técnicas e enriquecimento de conhecimento científico. Intitulou-se o relatório como “Aplicações biomédicas em doenças metabólicas, infeciosas e regeneração” e escolha da ordem dos capítulos relaciona-se com a cronologia da realização das atividades por ordem cronológica crescente. Todos os posters que surgiram dos trabalhos mencionados encontram-se em anexo no final do relatório de estágio. O Capítulo 1 intitulou-se de “Engenharia genética: produção in vitro de fatores de crescimento humanos”. Neste período de estágio, utilizou-se a recombinação genética, um processo que ocorre na ausência de mutações e que consiste na união de genes provenientes de dois genomas distintos resultando na formação de novos genótipos. A Escherichia coli (E.coli) é, normalmente, a bactéria de eleição para a realização de recombinação genética em laboratório, uma vez que a sua fisiologia e genética são bem conhecidas. As células transformadas são capazes de expressar a informação genética adquirida, como por exemplo, resistência a antibióticos e síntese de proteínas cuja informação genética é proveniente do DNA plasmídico. Assim, os plasmídeos contribuem para a diversidade genética da bactéria hospedeira, uma vez que codificam proteínas não específicas do DNA cromossómico. Este trabalho tem como objetivo desenvolver e implementar uma estratégia de produção de fatores de crescimento como proteínas recombinantes. Esta valência do estágio foi realizada no laboratório de Biologia LaBMI. O capítulo 2 intitula-se “Meios de cultura bacteriana sustentáveis” e resulta da necessidade de nas indústrias de biotecnologia reduzir o impacto dos custos da utilização de meios de cultura altamente dispendiosos, através de uma estratégia de economia circular mediante estratégias sustentáveis. Segundo a Organização das Nações Unidas para a Alimentação e Agricultura (FAO), os alimentos inicialmente destinados ao consumo humano, que saem da cadeia alimentar humana, são considerados perda ou desperdício alimentar. É possível reduzir a geração de resíduos com gestão sustentável e uso eficiente dos recursos naturais, mesmo por meio da prevenção, redução, reciclagem e reaproveitamento. Muitas de nossas frutas e vegetais são uma fonte natural de nutrientes, vitaminas e minerais e, portanto, as suas cascas podem ser usadas como uma fonte valiosa de meio de crescimento bacteriano. Este trabalho tem como objetivo demonstrar como certos resíduos alimentares podem ser utilizados para desenvolver um meio de crescimento bacteriano, permitindo assim o crescimento e desenvolvimento de bactérias sem quaisquer aditivos químicos. Esta valência do estágio foi realizada no laboratório de Microbiologia do LaBMI. O capítulo 3 denomina-se de “Doenças metabólicas: Diabetes, Neuropatia e NAFLD” em que as atividades de estágio se debruçaram sobre a aplicação de metodologias de análise de biomarcadores proteicos, lipídicos e glicídicos, bem como a análise de biomarcadores do stress oxidativo em diferentes patologias do espectro da síndrome metabólica como a diabetes. Estas atividades realizaram-se no âmbito dos projetos em curso dos orientadores em parceria com o i3S (Instituto de Investigação e Inovação em Saúde) e o LaBMI. Esta valência do estágio foi realizada no laboratório de Biopatologia química do LaBMI. A diabetes está associada a diversas morbilidades como a Neuropatia diabética, que é descrita como uma lesão nos nervos que ocorre devido à exposição prolongada a hiperglicemia, bem como a doença do fígado gordo não alcoólico (em inglês NAFLD) que é caracterizado pela acumulação excessiva de gordura nos hepatócitos associada ao aumento da secreção de hepatocinas (por exemplo, FGF-21). A hiperglicemia e a hiperlipidemia nestes doentes afeta diversas vias metabólicas provocando a acumulação de metabolitos tóxicos que tem como consequência a formação de espécies reativas de oxigénio (ROS), levando ao aumento do stress oxidativo e diminuição da atividade das enzimas antioxidantes. Este trabalho tem como objetivo estudar o stress oxidativo envolvido na Neuropatia Diabética e NAFLD quantificando a capacidade antioxidante total, e quantificação de FGF-21 em indivíduos com NAFLD com e sem diabetes. Finalmente no capítulo 4 foi realizado no âmbito da bolsa de investigação (BI) obtida durante o período de estágio, com o intuito de contribuir para o diagnóstico do novo coronavírus pandémico causador da COVID-19. Esta componente do estágio foi realizada nas instalações do LaBMI, em particular na Unidade de Diagnóstico Molecular e no laboratório de Virologia e no laboratório de Biologia Molecular. Em Wuhan, China, em dezembro de 2019 foi reportada a presença de um caso de pneumologia com etiologia desconhecida, mais trade identificada pela Organização Mundial de Saúde (WHO) como doença do coronavírus 2019 (COVID-19) provocada por infeção pelo vírus SARS-CoV-2. Devido ao rápido aumento de caos positivos e mortes, num curto período de tempo, a COVID-19 foi declarada pela WHO como uma pandemia. Globalmente, desse o início da pandemia até dia 10 de setembro de 2021, a COVID-19 provocou 46 028 82 mortes e 223 022 538 casos positivos. A identificação do RNA viral, nos possíveis infetados com SARS-CoV-2, é possível após isolamento e deteção dos ácidos nucleicos virais por RT-PCR em tempo real. Este capítulo tem como objetivo evidenciar os diferentes métodos de extração de RNA viral, identificação e diagnóstico do SARS-CoV-2.
- Página esquecida de Lopes-Graça: uma peça para o ensino vocacional do violonceloPublication . André, Filipa Dias de Oliveira Rolim; Barahal, Jed Anthony; Mikusova, KaterinaO presente relatório descreve e reflete o trabalho e atividades realizadas com alunos de violoncelo da ARTAVE durante o ano letivo 2020/2021, no âmbito da unidade curricular de Prática de Ensino Supervisionada inserida no mestrado em Ensino de Música – variante violoncelo da ESMAE/ESE – IPP. O estágio decorreu na Escola Profissional e Artística do Vale do Ave e permitiu o acompanhamento de aulas individuais de violoncelo de alunos do Curso Básico e do Curso Instrumentista e de aulas de conjunto (música de câmara). Como parte integrante deste relatório, foi desenvolvido um projeto de investigação que reflete a aplicação de uma obra de compositor português como parte do programa a apresentar na prova final do 8º grau de violoncelo, apresentando e demonstrando como a inserção de obras portuguesas no programa da disciplina de instrumento pode ser benéfica e enriquecedora no processo de ensino.
- Relatório de estágio: Biotecnologia aplicada ao diagnóstico e à produção de produtos inovadoresPublication . Lopes, Sofia da Silva; Baylina, Pilar; Fernandes, RúbenO presente documento apresenta o trabalho desenvolvido no Laboratório de biotecnologoa Médica e Industrial (LaBMI) inserido no porto Research Technology ᶓ Innovation Center (PORTIC) do Instituto Politécnico do Porto (IPP) e constitui o elemento final de avaliação do Mestrado de Bioquímica e Saúde-Ramo Biotecnologia. O LaBMI possui diferentes áreas de atuação de acordo com as distintas unidades funcionais que possui, de entre as quais, uma unidade de Diagnóstico Molecular devidamente reconhecida pela Entidade Reguladora de Saúde (ERS) (certificado ERS-E150638) e pertencente à rede nacional de laboratórios de referência de diagnóstico à COVID-19. O LaBMI acolhe também nas suas instalações a Startup AP Factory acompanhada pela STARTUP PORTO da Porto GLOBAL HUB (PGH), da qual recebe o devido apoio técnico, assim como a mentoria científica da equipa de coordenação do LaBMI. Assim, parate do estágio foi realizado na AP Factory que utiliza parte dos laboratórios do LaBMI, sob a responsabilidaded dos gestores desta Startup. Durante este ano de estágio, foram realizadas diversas atividades de aprendizagem em diferentes âmbitos, o que permitiu uma oportunidade única de aprendizagem tanto de métodos como de técnicas, contribuindo na globalidade para o enriquecimento de conhecimento científico. O capítulo 1 é apresentado como “Diagnóstico Molecular em Virologia Clínica: Relatório de Estágio numa unidade de diagnóstico laboratorial (ERS-E150638)” o trabalho aqui desenvolvido contribuiu para a testagem em massa que se verificou em todo o país com o objetivo de controlar a pandemia COVID-19. Pertencendo à rede nacional de laboratórios de referência de diagnóstico à COVID-19, o LaBMI colaborou com centros de saúde pertencentes aos agrupamentos ACeS Porto Ocidental, ACeSFeira/Arouca, ACeS Entre Douro e Vouga II e ACeS Aveiro Norte. Para além disso, foram realizados testes de amplificação de ácidos nucleicos (NAAT) e testes de antigénio à comunidade do Instituto Politécnico do Porto. No capítulo 2, o projeto desenvolvido decorreu na Startup AP Factory, que se encontra sediada no LaBMI, unidade do PORTIC. Como consequência dessa situação, todo o trabalho desenvolvido no âmbito deste projeto bem como a propriedade intelectual, pertence aos empreendedores e não à equipa de orientação formal. O mesmo se verifica no terceiro e último capítulo. O capítulo 2 baseia-se na reutilização de cascas de frutas no âmbito de um aditivo sustentável e económico para meios de cultura bacterianos. Este trabalho proporcionou a oportunidade da apresentação de um e-poster com título “Eco-friendly additive for bacterial growth media” na 14ª Edição do Encontro de Investigação Jovem (IJUP) e ainda a colaboração noutro e-poster de nome “Sustainable bacterial growth médium” apresentado no mesmo congresso (Anexos I e II). Por fim o Capítulo 3 é baseado em processos de Engenharia genética com o objetivo de produzir proteínas de interesse, fatores de crescimento, com interesse biotecnológico. Em colaboração com alguns investigadores do LaBMI, foi possível a apresentação de um poster intitulado “Avaliação do potencial anti tumoral de fármacos antidiabéticos em cancro da próstata” e no 17º Congresso Português de Diabetes. Foi possível ainda a contribuição em mais duas comunicações orais, também no 17º Congresso português de Diabete intitulados de “Efeito de testosterona e estradiol no paradoxo diabetes/cancro da próstata” e “Alterações morfopatológicas no rim de rato com obesidade e insulino-resistência” (Anexos III-V). Na área da microbiologia foi também possível colaborar na participação de 2 posters para apresentação na sociedade espanhola de microbiologia, “Oxidative stress genes involved in the virulence-dependent susceptibility to antibiotics in P. aeruginosa” e “The synergic effect of antibiotics and biofilm formation is dependent of oxidative stress genes in P. aeruginosa” (Anexos VI e VII). Por fim, juntamente com outros colaboradores, foi possível a participação da 12ª Edição da Angelini University Award- “Soluções de crise em Saúde: Identificar, Gerir e Cuidar” com um projeto denominado AGRO4COVID (Anexo VIII). O objetivo deste projeto é a criação de uma vacina comestível a partir de células meristemáticas de cenoura geneticamente modificadas, pretendendo criar um reforço da imunidade de grupo, atuando como terapia adjuvante às terapias convencionais, bem como facilitar a administração e adesão terapêutica e ainda apoiar a economia circular. Menção honrosa à participação do autor e restantes elementos do LaBMI no estudo europeu multicêntrico de efetividade das vacinas contra a COVID-19 realizado pelo Instituto Ricardo Jorge (INSA) (Anexo IX). Todo o trabalho desenvolvido contou com o apoio de uma bolsa de investigação designada PORTIC/LaBMI/IPP4COVID/2020/02.
- Secção de hormonologia do serviço de patologia clínica do Hospital Dr. Nélio Mendonça. Testes bioquímicos de rastreio pré-natal na população de grávidas da RAMPublication . Gomes, Marta Franco; Ornelas, Ilídio; Vieira, MónicaO presente relatório reporta o trabalho desenvolvido durante o estágio curricular do Mestrado em Bioquímica em Saúde, realizado na secção de Hormonologia do laboratório de Patologia Clínica do Hospital Dr. Nélio Mendonça. É apresentada a secção de Hormonologia com maior relevância para os parâmetros analíticos da função tiroideia, hormonas da fertilidade e da função gonadal, marcadores tumorais e cardíacos, marcadores de hipertensão, fármacos imunossupressores e marcadores bioquímicos de rastreio pré-natal. O estágio teve como principal objetivo integrar o quotidiano de um laboratório de análises clínicas, permitindo o contato com novos equipamentos e procedimentos, de modo a consolidar os conhecimentos adquiridos ao longo do curso. Para além da componente prática de aprendizagem foi também realizada uma recolha de dados com o objetivo de analisar os testes bioquímicos de rastreio pré-natal que ocorreram em dois períodos homólogos, compreendidos entre junho de 2019 e janeiro de 2021, bem como estudar o comportamento das variáveis clínicas, proteína plasmática A associada à gravidez (PAPP-A) e fração livre de subunidade β da hormona gonadotrofina coriónica humana (β-hCG livre), ao longo do primeiro trimestre da gravidez e nos diferentes grupos etários. No período em estudo, 1169 gestantes, com a idade média de 31 anos, realizaram os testes bioquímicos de rastreio pré-natal, no Serviço de Patologia Clínica do Hospital Dr. Nélio Mendonça. A recolha dos dados, em dois períodos distintos, permitiu evidenciar uma redução no número de gestações durante a pandemia de COVID-19, comparativamente com o período homólogo do ano anterior. A comparação entre as concentrações obtidas nos testes bioquímicos de rastreio pré-natal com os valores de referência mostrou que, na amostra em estudo, ambos os níveis hormonais de β-hCG livre e PAPP-A, apresentavam-se superiores aos valores de referência. Foi igualmente observada, em ambas as variáveis clínicas, a presença de outliers superiores. Contudo, como não foi realizada a conversão das concentrações obtidas de β-hCG livre e PAPP-A em múltiplos de mediana (MoMs), neste estudo, não é possível inferir conclusões relativamente à ausência ou presença de cromossomopatias.
- Contributos da biotecnologia de fagos: aplicações à indústria têxtil e agroindústriaPublication . Veiga, Marlene de Fátima Soares Sebastião; Fernandes, Rúben; Baylina, PilarOs fagos são vírus que infetam bactérias. Devido à sua natureza são de fácil expansão, económicos e geralmente seguros para manipulação em laboratório. Duas perspetivas da utilização dos fagos em biotecnologia são descritas neste trabalho. Por um lado, foram utilizados fagos no desenvolvimento de materiais têxteis com propriedade antivíricas. Por outro lado, foi descoberto um novo fago, com potencial atividade para controlo de infeções bacterianas em plantas. Neste estudo dos têxteis avaliados pelos métodos standard, utilizando o fago philBB-PAA2 no seu hospedeiro P. aeruginosa, a amostra que mostrou melhores resultados foi a B e apresentou uma taxa de redução viral acima de 98% após 4h de contacto. Com o intuito de avaliar a capacidade de biocontrolo de pragas vegetais causadas por P. syringae mediante terapias fágicas, testou-se o potencial terapêutico de um fago recentemente isolado e testado em culturas de rebentos de tomateiro. Os resultados preliminares, revelaram um significativo aumento (786%) do rebento de tomateiro infetado após a fagoterapia, aumentando cerca de 8 vezes. A aplicação biotecnológica de fagos, demonstra um enorme potencial industrial, não apenas para o aperfeiçoamento de biomateriais antivíricos, mas também para as diversas bioindústrias médicas, veterinárias, zootécnicas e agrícolas pela terapia fágica.
- Jogo de realidade virtual com foco na experiência sonoraPublication . Machado, José Ferreira; Conceição, Marco Paulo Barbosa; Santos, Pedro Emanuel OliveiraDescrição do desenvolvimento de um jogo em realidade virtual, tendo como foco principal o som, a sua importância, qualidade e implementação, como tentativa de elevar o padrão atualmente em vigor para o som nos videojogos. Fez-se o design da experiência, assim como listagens de assets a serem desenvolvidos, tendo sido tratado depois da criação e implementação dos mesmos. Finalmente, realizaram-se sessões de teste, cujos resultados foram depois considerados para o desenvolvimento de projetos futuros. Para este desenvolvimento, utilizou-se o Unity como motor de jogo, FMod como middleware e Google Resonance como plugin de espacialização, tendo-se ainda experimentado, mas abandonado, o uso do Steam Audio.
- Criação sonora e musical para uma curta-metragemPublication . Branco, António Moreira; Conceição, Marco Paulo Barbosa; Marques, José Telmo RodriguesInserido no contexto da curta-metragem Henry!, este projeto tem como objetivo desenvolver uma visão criativa sobre a criação sonora e musical de um filme. Com base no trabalho de autores como Walter Murch e Liz Greene, num enquadramento teórico e contextual, farei as minhas próprias análises de trechos de filmes, seguindo com uma desconstrução da banda sonora do filme Henry!, e concluindo com observações sobre o que foi feito. É pretendido responder a questões como: qual a relação que deve ser estabelecida entre o departamento do som e o realizador? Até que ponto o design de som e a composição musical podem trabalhar juntos para sustentar a história de um filme? Que tipo de trabalho a fusão dessas duas disciplinas envolverá na fase de pré-produção e na rodagem? Que tipo de tratamento devem ter os diálogos, de modo que não sejam prejudicados pela restante massa sonora que os envolve (design de som, música e foley)? É com esperança que o entusiasmo presente no desenvolver deste projeto, seja aparente e apele à mesma postura por parte do leitor principiante interessado em integrar-se neste mundo do trabalho no cinema.
- A memorização como ferramenta na resolução de problemas técnicos na prática individual na flauta transversal. Formas de motivação para estudo individualPublication . Golegã, Inês Buiza; Alves, Ana Raquel de Oliveira Milheiro Lima; Pereira, Marco; Marinho, FernandoO projeto aqui apresentado pretende averiguar quais os contributos que a memorização pode ter quando utilizada como ferramenta pedagógica para a superação de dificuldades técnicas na flauta transversal. De facto, a temática da memorização é imensamente abordada e explorada na diversa literatura destinada à execução instrumental. Contudo, a grande maioria dos artigos tem como principal objetivo a otimização da memória na performance instrumental em público. Neste contexto, a memorização surge associada ao benefício do instrumentista se desprender da partitura na procura de uma identidade musical e de uma maior liberdade na performance. Porém, a redação deste projeto visa aprofundar o tema da memorização não pela via do “momento de performance”, mas pela integração da memória no estudo contínuo e diário do aluno para superação das dificuldades técnicas. Busca ainda descobrir que papel pode a memorização de diferentes passagens técnicas ter na motivação do aluno. Neste documento são também apresentados o relatório de estágio e as planificações de aulas elaboradas no âmbito da disciplina “Prática do Ensino Supervisionada”, integrada no plano de estudos do segundo ano do Mestrado em Ensino de Música da Escola Superior de Música e Artes do Espetáculo. O estágio foi realizado no Conservatório de Música do Porto (CMP) sendo composto por aulas individuais de Flauta Transversal e por aulas de classe de conjunto, nomeadamente o Grupo de Música Contemporânea do CMP. Com o intuito de avaliar os contributos da memorização para a evolução técnica instrumental, foi elaborado um questionário em formato digital destinado a estudantes e professores de flauta. Foram também realizadas, como complemento académico e científico, duas entrevistas semiestruturadas a docentes de escolas nacionais, com vista a perceber de que forma a memorização se articula com a prática pedagógica.
- Em busca da aleteia perdidaPublication . Pereira, Jónatas Eduardo Santos; Penha, Rui Luís NogueiraA arte sempre esteve envolvida na questão da verdade, talvez nunca mais do que desde meados do século passado, quando rivalizou com a ciência qual das duas tinha a sua custódia. Esta tese é uma contribuição para uma poética da composição musical. É, também, uma reflexão filosófica pelo escorregadio e intrincado significado de verdade. O principal objetivo é chegar à verdade como encontro - aleteia - no contexto bíblico, dentro de uma mundividência cristã, e não no sentido incompleto do pensamento heideggeriano. Chegar-se-á a uma compreensão de verdade mais profunda, numa dimensão relacional, que se defenderá ser crucial para o ofício de compor música. Esta abordagem será refletida em exemplos concretos das composições escritas ao longo do período de mestrado.
- Etidronate-based organic salts and ionic liquids: In vitro effects on bone metabolismPublication . Teixeira, Sónia; Santos, Miguel M.; Branco, Luís C.; Costa-Rodrigues, JoãoBisphosphonates are a class of drugs widely used for the treatment of several pathologies associated with increased bone resorption. Although displaying low oral bioavailability, these drugs have the ability to accumulate in bone matrix, where the biological effects are exerted. In the present work, four mono- and dianionic Etidronate-based Organic Salts and Ionic Liquids (Eti-OSILs) were developed by combination of this drug with the superbases 1,1,3,3-tetramethylguanidine (TMG) and 1,5-diazabicyclo(4.3.0)non-5-ene (DBN) as cations, aiming to improve not only the physicochemical properties of this seminal bisphosphonate, but also its efficacy in the modulation of cellular behavior, particularly on human osteoclasts and osteoblasts. It was observed that some of the developed compounds, in particular the dianionic ones, presented very high water solubility and diminished or absent polymorphism. Also, several of them appeared to be more cytotoxic against human breast and osteosarcoma cancer cell lines while retaining low toxicity to normal cells. Regarding bone cells, a promotion of an anabolic state was observed for all Eti-OSILs, primarily for the dianionic ones, which leads to an inhibition of osteoclastogenesis and an increase in osteoblastogenesis. The observed effects resulted from differential modulation of intracellular signaling pathways by the Eti-OSILs in comparison with Etidronate. Hence, these results pave the way for the development of more efficient and bioavailable ionic formulations of bisphosphonates aiming to effectively modulate bone metabolism, particularly in the case of increased bone resorption.