Lopes, Alexandra Filipa BrancoRocha, HugoSilva, Regina A.Takács, Petra2024-01-262024-01-262023-09-04http://hdl.handle.net/10400.22/24727Retinopatias hereditárias têm uma prevalência de 1:1380 indivíduos, sendo que a retinite pigmentosa é a mais comum, com mais de 50 genes envolvidos. A formai mais severa é a ligada ao X, que corresponde a 5-15% dos casos de retinite pigmentosa e o gene RPGR está associado a 70-80% destes casos. O ORF15 é uma região altamente repetitiva no gene RPGR, de baixa complexidade e rica em purinas que excede 1kb de tamanho, tornando-o dofícil de sequenciar, seja por Sanger ou NGS. Dada esta dificuldade, o objetivo deste projeto foi desenhar novos primers para sequenciar esta região utilizando NGS multiplex, por meio de enriquecimento baseado em amplicões (amplicon based enrichment) e definição de PCR específicos. Foi ainda realizada uma compilação dos testes previamente executados pelo laboratório de retinopatias, para realizar uma análise descritiva e selecionar casos potencialmente relacionados com ORF15 do gene RPGR, para serem alvos de sequenciação. O laboratório consegui sequenciar esta região com sucesso, obtendo uma cobertura média de 1196 leituras, permitindo assim, implementá-la no laboratório e oferecer uma testagem mais ampla aos clientes, contribuindo para melhorar as capacidades diagnósticas para estas doenças.porRetinopatias hereditáriasRetinite pigmentosaDoenças hereditárias da retinaNGS (Next-generation Sequencing)ORF15RPGRmaster thesis203478924